Se utilizan diferentes modos del analizador de RF de rayos x para probar diferentes tipos de muestras. Por ejemplo, el modo de aleación se utiliza para analizar varios tipos de aleaciones, el modo de minería se utiliza para detectar diferentes tipos de mineral de hierro, mineral de cobre, mineral de titani, mineral de plomo, etc, y el modo de metal precioso se utiliza para probar muestras que contienen metales preciosos como Au, Ag y Pt como el elemento principal. Diferentes modos de análisis están diseñados para diferentes aplicaciones.